用于宏基因组测序分析的人类粪便样品取样方法
一、样本筛选
1.如果受试者存在以下情况,则需剔除:
(1)5年内有过胃肠道大手术的(胆囊切除术和阑尾切除术);
(2)有过主要肠道切除手术;
(3)炎症性肠病(IBD),包括溃疡性结肠炎、克罗恩病(Crohn’s disease)或不确定的结肠炎;
(4)肠易激综合症(IBS);
(5)持久性、传染性胃肠炎、结肠炎或胃炎;持续或慢性腹泻的病因不明,艰难梭状芽胞杆菌感染(复发)或幽门螺杆菌感染(未治疗);
(6)慢性便秘;
(7)历史性的胃或肠道溃疡、胃肠道出血、腹痛、消化不良、胃肠里急后重(下坠)或排便困难,胃肠道或结肠息肉或包块或发育不良或癌症,以及腹泻或传染性胃肠炎;
(8)药物治疗记录:含碱式水杨酸铋, Pepto-Bismol, Kaopectate, Maalox Total Relief, Bismatrol, Pink Bismuth, Stomach Relief, Stress, Walgreens Soothe 和其它类似的铋碱式水杨酸盐的药物成分的药物。
2.对于存在历史性胃肠道疾病患者执行简单临床检查:腹部压痛、疼痛及肛门疾病。
二、准备材料
微生太®粪便采集包一套:内含无菌粪便采集管三个,mark笔一支,一次性手套一双,自封袋一个;冰或冰袋或干冰,冰盒一个。
三、收集方法
1.自然排便法
(1)拆开微生太®粪便采集包,在采集管管壁和管盖以及自封袋上都写上样品名称(样品名称只能用英文字母或阿拉伯数字或两者的组合,而且字符数大于3小于9);
(2)排便前先排尽尿液,以免尿液污染;将马桶冲洗干净,排便在无水处,然后用取样勺挖取没有接触空气的粪便2g(1-2小勺),拧紧盖子,重复取3管,保存于自封袋;
(3)将自封袋放入冰盒,用冰或冰袋或干冰填埋,以制造低温环境,阻止菌群生长,2小时内保存到-80℃冰箱(如果是干冰填埋,只要在干冰挥发完之前送达即可);
(4)所有样品收集完毕后,将每人三管中的一管粪便寄送到北京微生太科技有限公司实验室,进行宏基因组测序分析或菌群结构谱测序分析,寄送时需要干冰冷冻。
2.直肠拭子法
不易获得粪便时,可采用直肠拭子法采集。肥皂、水和 70%的酒精清洁肛门周围,将无菌拭子用生理盐水湿润后插入肛门 4~5cm(幼儿 2~3cm),在肛门括约肌处轻柔的旋转,于肛门隐窝处取样,可在拭子上明显见到粪便,然后保存在无菌采样管。其他步骤参考“自然排便法”。
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